دبیرخانه در وزارت امور اقتصادی و دارایی تشکیل میشود و عهده دار وظایف زیر خواهد بود:
1 - انجام امور اداری مربوط به تشکیل جلسات شورا. ابلاغ و پیگیری مصوبات
2 - حضور فعال در مجامع بینالمللی و تشریح اقدامات کشور در مبارزه با پولشویی
3 - پیگیری اجرا و اخذ گزارش عملکرد اشخاص مشمول. نظارت و بازرسی (دورهای. اتفاقی و موردی) از اشخاص مشمول بهمنظور اطمینان از اجرای آیین نامه ها و دستورالعملهای مصوب در حوزه مسئولیت اشخاص مشمول و مشاغل غیرمالی مشمول و تهیه گزارش اجرای قانون و مقررات مربوط هر شش ماه یک بار و ارسال به شورا.
4 - رتبه بندی سالانه اشخاص مشمول در مورد میزان رعایت مقررات مربوط به پولشویی و در صورت تصویب شورا. اعلام عمومی آن.
5 - پاسخگویی به مراجع ذیصلاح. اعلام مواضع. تبلیغات. پشتیبانی از دیدارگاه الکترونیک دبیرخانه و توجیه عمومی مردم با هماهنگی مراجع مسئول.
6 - هماهنگی درتشکیل دورههای آموزشی در داخل و خارج کشور و تدوین و انتشار جزوات آموزشی.
7 - برنامه ریزی سالانه اجرای قانون و آیین نامه های ذیربط توسط مجریان و اشخاص مشمول.
8 - حمایت مادی و معنوی از اشخاص مشمول و کارکنان ذیربط که در راستای انجام وظایف خود در اجرای مقررات مبارزه با پولشویی مورد شکایت و تعرض ارباب رجوع قرار گیرند.
9 - به روزرسانی آیین نامه ها و دستورالعملهای ذیربط از طریق مراجع قانونی.
10 - تهیه پیشنویس آیین نامه های لازم و اعلام نظر در مورد دستورالعملهای پیشنهادی اشخاص مشمول.
11 - اعلام راهها و فرآیندهای جدید پولشویی و تامین مالی تروریسم در کشور و پیشنهاد اصلاح آیین نامه ها و دستورالعملها در صورت نیاز.