هیات مدیره اطاقهای تعاون متشکل از 5 نفر از میان اعضاء تعاونی ها می باشند که حتی الامکان از مدیران تعاونیهای کشاورزی و روستایی و عشایری. صنعتی. معدنی. عمران شهری و روستایی. توزیع خواهند بود و برای مدت سه سال از طرف مجمع عمومی نمایندگان انتخاب می شوند.